La région de Bourgogne Franche-Comté est partagée entre trois bassins versants : Loire-Bretagne, Seine-Normandie et Rhône-Méditerranée. Plusieurs arrêtés ministériels récents approuvent les Schémas Directeurs d’Aménagement et de Gestion des Eaux (SDAGE) pour cette nouvelle période et arrêtent les programmes de mesures qui leurs sont associés. Par ailleurs, trois autres arrêtés approuvent les Plans de Gestion des Risques d’Inondations (PGRI) pour ces mêmes bassins versants et pour la même période. 

Loire-Bretagne

Seine-Normandie

Rhône-Méditerranée